药物基因组研发思路
2017-01-20 01:43:56 0 举报
AI智能生成
药物基因组学流程研发思路
作者其他创作
大纲/内容
2017.3.20
样本量较小的散发样本
基本分析
基本分析流程中,调整annovar注释结果,先剔除有害性预测注释,整合pharmGKB和Drugbank数据库注释信息
高级分析
高级分析内容以7.3流程为主得到基因share和位点share的结果,位点share也先取10%
高级分析:通路富集不变,以药物名称代替基因名称,并以drugbank数据中和药代动力学,药理学的基因为种子进行最终结果筛选代替phenolyzer
补充协议
调研和药物基因学相关的数据库
2017.8.15
样本量较大的散发样本
关联分析思路
调研药物基因组学关联分析思路
以李莉项目数据为测试数据进行调研方法重复以及完善
家系样本
按照目前流程分析内容分析即可
2017.4.15
基因set
药代动力学
药物吸收相关基因
药物转运相关基因
药物代谢相关基因
药物排泄相关基因
药理学
药物靶标相关基因
药物基因组样本
药物基因组样本基本上都是患病样本
case
病人药效不佳
病人药物副反应
control
病人药效理想
病人无不良药物反应
癌症样本居多
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