石渠棘球绦虫基因组学（小猪）
2017-06-23 23:28:39 1 举报AI智能生成
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石渠棘球绦虫是05年在中国四川发现的新物种，因同属寄生虫危害重大而备受关注。
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大纲/内容
石渠棘球绦虫基因组学研究
研究进展
棘球蚴基因组学研究进展
利用RNA干扰技术研究基因功能
主要意义：测定基因所编码蛋白的作用及演变，鉴定和克隆，用于疫苗、诊断或药物的开发靶基因。
2013年4月份在Nature上发表细粒棘球绦虫E.g、多房棘球绦虫E.m、猪带绦虫、微口膜壳绦虫四种重要绦虫基因组的测序
2013年在Nature Genetic上发表细粒棘球绦虫基因组测序和基因功能分析工作
基因组下载
Http://www.sanger.ac.uk/reasources/downloads/helminths/
基因组的整体特征：（大小、组成、同源框基因的丧失、基因家族的扩充、特异性基因、与其他直系同源关系）
石渠棘球绦虫研究进展
病原学
石渠棘球绦虫发现（05年肖宁等发现）
成虫
石渠棘球绦虫只有两个节片，孕节直接与未成熟节片相连是其独特的特征。
相比其他棘球绦虫：小钩更小，节片更少，孕节中虫卵更少，成熟节片中生殖孔位置。
幼虫
（及棘球蚴）囊壁+原头蚴+生发层+子囊+囊液
包囊形态：单房型囊，通常缺少子囊和孙囊，囊腔充满囊液，无色透明或微带黄色
虫卵
卵圆形，内含六钩蚴
石渠棘球绦虫基因组学的研究进展
测序
石渠棘球绦虫基因组测序重要是cox基因、nad基因、和trna基因的部分基因测序。连接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=Echinococcus%20shiquicus
全基因组测序还未完成
分子标记：
cox1基因
长度：1608bp （肖宁等报道）
GenBank登录号为AB159136（NC_009460）
nad1基因
长度：897bp（Nakao等报道）
GenBank登录号为AB208064
ITS序列（缺乏报道）
流行病学
流行地区：青藏高原（05年首次发现于四川省甘孜藏族自治区石渠县，后发现青海治多县和达日县等地区都有分布）
生活史：森林型；
宿主：
与E.g中绦期的区别在于石渠棘球绦虫的中绦期的可育囊内无子囊存在
主要在蔵狐（终末宿主；小肠）和高原鼠兔（中间宿主；肺）之间传播循环，尚未发现人可以感染
终末宿主2：犬（偶见）
06年在青海治多县通过动物解剖发现高原鼠兔有15.1％（14/39）被石渠棘球绦虫感染
诊断预防
特异性检测引物（大小471bp）
上游引物：5'-GCTTTAAGTGCGTGACTTTTAATCCC-3'
下游引物：5'-CATCAAAACCAGCACTAATACTCA-3'
nad1基因特性性引物（大小442bp）
上游EsF：5'-TAATTCTCAGTCTCGTAAGGGTCCG-3'
下游EsR：5'-CAATAACCAACTACATCAATAATT-3'
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