基因组学绪论+第一章
2021-03-01 21:08:36 13 举报AI智能生成
基因组学 杨金水教授的课程笔记
作者其他创作
大纲/内容
基因组学-基因组计划缘起
首次提出：科学家想快速准确测出日本受原子弹影响人群的基因组
推波助澜：1986年，杜贝提出基因测序两条路
DNA测序
基因组作图
成功里程碑
2001年人类基因组工作草图的发表
基因组学重要进展
基因组测序与注释
人类基因组DNA成分百科全书计划
非编码RNA
单细胞测序
基因组表观遗传
DNA双螺旋结构的发现
孟德尔提出所谓的”遗传因子理论“
沃森和克里克使用富兰克林的图谱进行创造，提出双螺旋结构
基因组-DNA-RNA-蛋白质
基因组学概念：概括涉及基因组作图、测序、和整个基因组功能分析的遗传学学科分支
DNA结构特点
DNA由两条具有极性的互补单链组成
两条互补单链走向相反
DNA双螺旋大小沟槽交替排列
碱基配对原则:A-T，C-G，A-T配对形成2对氢键，C-G配对形成3对氢键。
每旋转一圈为10.5 bp(碱基对)
RNA的结构与生物学
生物体内几乎所有的RNA分子均为单链。
RNA分子中对应于DNA中胸腺密啶(T)的碱基由尿啶(U)取代。
RNA分子也可形成双链RNA，即可分子间配对，也可分子内配内。
配对原则与DNA碱基配对类似,只是DNA中的A-T配对在RNA中为A-U配对。
RNA分子内配对可形成茎环(或发夹)结构。
配对原则与DNA碱基配对类似,只是DNA中的A-T配对在RNA中为A-U配对。
RNA分子内配对可形成茎环(或发夹)结构。
RNA分子易于断裂，长度有限。
生物体内几乎没有任何双链环化RNA分子。
蛋白质
模体是功能蛋白质的结构部件。
许多保守的转录因子蛋白含有锌指结构(zinc finger)，是十分常见的蛋白质基序。
锌指基序含3个二级结构:
α-螺旋，β-折叠和转环
蛋白质的三级结构中结构和功能上相对独立的区域，称为域(domain)。
基因组结构特征
C值悖理
生物体的单倍体基因组所含DNA总量称为C值。
生物基因组的大小同生物的复杂性及其在进化上所处的地位无关
基因组DNA的顺序组成
单一顺序
中度顺序
高度重复序列
基因与基因家族
基因
经典遗传学:决定表型的独立的遗传单位，可在上下代之间传递。
分子遗传学:由一段可转录的区域和调控区域组成的DNA序列，表达单位。
基因家族
同一物种或不同物种中来自一个共同的祖先，因加倍趋异而产生的一组具有相似顺序组成的基因成员。
具有氨基酸顺序相似性
具有相同的功能域
假基因
来源于功能基因但已失去原有活性的DNA顺序
重复假基因
加工假基因
残缺假基因
单一假基因
真核基因组与原核基因组
差别
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