甲基化捕获测序分析
2021-11-05 13:58:16 3 举报1111
作者其他创作
大纲/内容
DNA甲基化鉴定
比对率唯一比对率
甲基化水平分析
bam
覆盖度测序深度探针捕获效率
修剪后的数据
bismark
hg19
trim-galore
通过质控的数据
bismark比对
建立索引
FastQC
filtered bam
（PE）比对率及甲基化信息报告
样本相关性、聚类和PCA分析
picard标记并去除PCR重复
差异性甲基化位点分析
差异性甲基化区域分析
提取5MC位点
差异甲基化基因功能（go）富集分析
差异性甲基化区域注释
sorted bam
去除低质量碱基和接头
原始数据
cleandata质控报告
rawdata质控报告
samtools排序
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