23生化-基因工程+分子技术
2022-02-06 16:48:58 0 举报
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生化-基因工程+分子技术
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大纲/内容
重组DNA技术
工具酶
①限制性核酸内切酶RE(DNA内部切割3'-5'磷酸二酯键)
保护细菌(存在细菌体内,可限制外源性DNA,保护自身DNA)识别DNA特异序列,裂解磷酸二酯键,切割DNA
分类
REⅠ
REⅡ:精确切割
回纹序列(反向重复序列)→粘性末端
有特异酶解位点,无连接酶活性,其连接指同一限制酶切位点的连接
REⅢ
粘性末端(黏端)
Ⅱ型RE错位切割双链DNA,产生的5'或3'突出末端
回文结构
反向重复序列,指在两条核苷酸链中,从5'→3'方向的核苷酸序列完全一致。大多数RE的识别序列为回文结构
②DNA连接酶
两条DNA链上,有一条链上有缺口→催化形成3’-5'磷酸二酯键
③DNA聚合酶Ⅰ
功能
5’-3'的聚合活性
3’-5'的核酸外切酶活性
5’-3'的核酸外切酶活性
缺口平移法制作高比活性探针
DNA序列分析
类型
大片段Kelown:5’-3'的聚合活性、3’-5'的核酸外切酶活性
3'端标记
逆转录酶→cDNA(互补DNA)→DNA
参与互补DNA的第二条链的合成
小片段:5’-3'的核酸外切酶活性
④逆转录酶
合成cDNA
替代DNA聚合酶I进行填补,标记或DNA序列分析
⑤多聚核苷酸激酶
5’端标记
(ATP)磷酸化标记
标记探针
⑥末端转移酶
+dC(脱氧胞嘧啶)
3'末端加尾
⑦碱性磷酸酶
切除末端磷酸基
载体(顺风车)
概念
携带目的外源DNA片段,实现目的DNA在受体细胞中的无性繁殖或表达
分类
克隆载体(顺风车+复制)
特点
自主复制功能(最基本)
至少有个选择标志(抗嘌呤霉素标志)
单一酶切位点
常用
质粒
主要存在细菌染色体外的、能自主复制和稳定遗传的DNA分子,环状双链的超螺旋结构,有些质粒可携带抗药性基因,可含克隆位点
噬菌体DNA
其他
柯斯质粒载体
细菌人工染色体载体
酵母菌人工 染色体载体
表达载体
基因工程的基本步骤
分→选→接→转→筛
分:目的基因的获取分离
①化学合成法,已知某基因的核苷酸序列
②基因组DNA文库法
限制性核酸内切酶获取目的基因
③cDNA文库法
找mRNA→cDNA(逆转录酶)
④PCR法
已知目的基因或DNA片段两端序列,合成引物,体外高效扩增
选:载体选择与构建
质粒
自我复制
选择标志
接:目的DNA与载体连接
RE+连接酶
转:重组DNA转入受体细胞
转化:最常用,质粒→大肠杆菌、酵母细胞
转染:质粒→真核(不包括酵母细胞)
感染:质粒→病毒
筛:重组体的筛选与鉴定
借助载体遗传标志筛选
抗生素抗性标记
基因的插入失活/插入表达特性
标志补救方法
噬菌体的包装特性
序列特异性筛选
RE酶切法
PCR法
核算杂交法
DNA测序法
亲和方法
应用
基因诊断
基因治疗
基因的矫正、基因的置换(理想)
基因增补(最主要)
基因的失活、沉默
生物制药
基因组学
基因组
一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套信息
真核(染色体DNA及线粒体或叶绿体DNA的全部序列)
编码序列
非编码序列
细菌
拟核中DNA序列
质粒
病毒
DNA
RNA
真核:多复制子,单顺反子
原核生物:单复制子,多顺反子
分子生物学技术
分子杂交与印记技术
分子杂交
DNA变性后,如果将不同种类的DNA单链或RNA放在同一溶液中,只要核酸单链之间存在一定碱基配对,可能形成杂化双链
形成D-D,D-R,R-R等
印迹技术
DNA片段变性为单链后,利用NC膜将其转化为固化相分子,放入杂交反应溶液中,溶液中具有互补序列的DNA或RNA单链分子就可以结合到存在于NC膜上的DNA分子上
分类
DNA印记S
RNA印记N
蛋白质印记W
探针技术
带有特殊可检测标记的核酸片段,具有特定序列,能够与待测核酸片段互补结合
检测核酸样品中特定基因
PCR技术
体外目的DNA扩增
基本成分
模板DNA
特异DNA引物(扩增特异DNA序列)
耐热性DNA聚合酶
dNTP及含有Mg2+的缓冲液
基本步骤
①变性:加热至94℃,DNA变性为单链
②退火:下降至事宜温度(一般较Tm低5℃),引物与模板DNA结合
③延伸:升至72℃,DNA聚合酶以dNTP为底物合成DNA
主要用途
目的基因的克隆
基因的体外突变
DNA和RNA微量分析
DNA序列测定
基因突变分析
基因文库
一个包含了某一生物体全部DNA序列的克隆群体
分类
基因组DNA文库:以DNA片段的形式储存着某一生物的全部基因组DNA信息
cDNA文库:包含某一组织细胞在一定条件下所表达的全部mRNA经逆转录而合成的cDNA序列的克隆群体,它以cDNA片段贮存着该组织细胞的基因表达信息
生物大分子相互作用研究技术
蛋白质
标签蛋白沉淀
酵母双杂交技术
D-Pr
电泳迁移率变动分析
染色质免疫沉淀技术
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