生信文件处理
2023-03-23 08:29:58 3 举报生信处理流程
作者其他创作
大纲/内容
.fa
ATAC_FC.bigwig
生成阴性集合
chr22_k27ac_neg_blackd_1kb.bed
- blacklist
bedtools slop
bedtools getfasta
chr22_k27ac_pos.bed
chr22.bed
bedops wig2bed
bedtools intersect
chr22.fa
chr22_k27ac_pos_1kb.bed
chr22_k27ac_neg_blackd.bed
+ H3K27ac_PP.bed
生成阳性集合
bedtools intersect -f 0.5
bedtools makewindows
扩展到1kb
bigwigtowig
chr22_k27ac_neg.bed
font color=\"#e74f4c\
ATAC_FC.bed
得到ATAC信号得分
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