技术流程图
2024-09-21 09:49:43 0 举报生物文献技术路线
作者其他创作
大纲/内容
杭州湾（HZ）青蟹
主成分与相关性分析
不同盐度处理沿PC1分离，不同种群沿PC2分离；具有良好的组内相关性
GO富集分析与GSEA
DEGs主要与离子转运、能量代谢、渗透代谢和甲基转移酶活性有关
转录组比对与功能注释
总比对率在86.19-88.75%之间；NR注释到的基因最多
低盐（5ppt）
漳州湾（ZZ）青蟹
培养96h
对照（20ppt）
低盐胁迫下，青蟹利用胞外非等渗的调节和胞内等渗调节相结合的方式进行渗透调节
差异表达基因分析
两个群体的鳃组织在低盐胁迫下共有DEGs有191个，杭州湾特有的DEGs有272个
RNA测序质量评估
Q20、Q30碱基含量92%以上，该测序数据适合后续数据分析
鳃组织结构
RNAseq
测序平台：NovaSeq 6000项目：真核有参样本：鳃
渗透调节相关酶活性
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